Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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