Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tgm1Q9JLF6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tgm1Q9JLF6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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