Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl39Q9JKF7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mrpl39Q9JKF7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mrpl39Q9JKF7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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