Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp29Q9ES63 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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