Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rhox9Q9EQM5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rhox9Q9EQM5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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