Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms