Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Capns2Q9D7J7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Capns2Q9D7J7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Capns2Q9D7J7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Capns2Q9D7J7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Capns2Q9D7J7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms