Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms