Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms