Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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