Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms