Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpusd4Q9CWX4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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