Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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