Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Mrpl3Q99N95 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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