Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms