Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms