Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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