Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Slc8b1Q925Q3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Slc8b1Q925Q3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms