Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Fam20bQ8VCS3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms