Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ssh3Q8K330 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssh3Q8K330 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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