Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prpf39Q8K2Z2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prpf39Q8K2Z2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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