Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcho1Q8K285 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Fcho1Q8K285 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms