Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FgbQ8K0E8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms