Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trip10Q8CJ53 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms