Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltbp1Q8CG19 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ltbp1Q8CG19 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ltbp1Q8CG19 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ltbp1Q8CG19 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ltbp1Q8CG19 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp1Q8CG19 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms