Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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