Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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