Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4aQ8BW72 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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