Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PgghgQ8BP56 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms