Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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