Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BGC1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms