Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf516Q7TSH3 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms