Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Actn1Q7TPR4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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