Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Vma21Q78T54 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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