Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms