Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorQ6ZPI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms