Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EsrrbQ61539 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
EsrrbQ61539 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EsrrbQ61539 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EsrrbQ61539 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EsrrbQ61539 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms