Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf3Q60765 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms