Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf608Q56A10 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms