Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn34b4Q3V0X2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34b4Q3V0X2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms