Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc27Q3V036 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms