Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp19Q3UJD6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms