Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b2Q3UJB0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms