Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms