Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LbrQ3U9G9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms