Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm3371-202ENSMUST00000177827 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf166Q3U9F6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms