Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms