Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf40Q3U319 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf40Q3U319 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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