Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kdm4dQ3U2K5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms