Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.5 ms